В.И. Трухачев руководит вузом с 1999 года, за это время деятельность Ставропольского ГАУ отмечена высокими наградами, в числе которых присуждение вузу премии Правительства РФ в области качества (2011г., 2005г.), премии Министерства образования и науки РФ «Системы обеспечения качества подготовки специалистов» (2010г., 2005г.), признание вуза победителем Международного турнира по качеству стран Центральной и Восточной Европы (2011г., 2007г.).

Укрепилось положение университета и в международном образовательном пространстве. Вуз является Призером престижного Европейского конкурса в области качества «Excellence Award» Европейского фонда менеджмента качества (EFQM) (2013г., 2010г.), одним из 2-х университетов в Европе, которые за всю 21-летнюю историю существования Европейского конкурса в области качества добились высокого уровня Призера.

По результатам ежегодного мониторинга эффективности образовательных организаций высшего образования, проводимого Министерством образования и науки РФ, Ставропольский государственный аграрный университет в 2011-2013 гг. признан лучшим среди аграрных вузов России (первое место в рейтинге). 

Как депутат Думы Ставропольского края В.И.Трухачев проводит большую работу на своем избирательном округе, оказывает постоянную помощь муниципальным органам власти Петровского и Грачевского районов в решении различных проблем.